Lekarska działalność usługowa prowadzona jest na pięciu stacjonarnych pododdziałach (łącznie 50 łóżek), których profil zależy od wieku chorych dzieci oraz rodzaju jednostek chorobowych. Postępowaniem diagnostycznym i leczniczym objęte są dzieci w wieku od 1. miesiąca do ukończenia 17 lat. Ponadto w Izbie Przyjęć, w ramach stałego „ostrego” dyżuru udzielana jest pomoc ambulatoryjna. 

Dysponujemy dobrze wyposażonymi pracowniami diagnostycznymi, a laboratorium naukowe umożliwia realizację projektów badawczych. W pracowniach diagnostycznych posiadamy nowoczesny sprzęt, pozwalający na przeprowadzenie badań z zakresu gastroenterologii, pulmonologii, neurologii, kardiologii dziecięcej i antropometrii oraz ocenę psychologiczną i fizjoterapeutyczną (z możliwością prowadzenia rehabilitacji ruchowej i oddechowej).

Działalność lecznicza jest ściśle powiązana z dydaktyką i działalnością naukową pracowników Uczelni.